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產(chǎn)品名稱:NGS高通量靶向SNP檢測試劑盒

產(chǎn)品型號:allegro

更新時間:2024-11-01

產(chǎn)品報價:

產(chǎn)品特點:單引物靶向基因分型(SPET)試劑盒提供了一種快速,可定制的,可擴展,經(jīng)濟高效的方法,使用新一代測序技術(shù)對各種生物進行有針對性的基因分型,是可以取代基因芯片的一種新方法。

allegroNGS高通量靶向SNP檢測試劑盒的詳細(xì)資料:

目前常用的基因分型手段主要是基于NGS的簡化基因組方法,包括GBSRAD、ddRAD等,這些簡化基因組方法都能夠提供開放、無偏差的基因分型,但卻沒有一種技術(shù)可以實現(xiàn)針對靶向基因區(qū)的高效分型——單基因、基因家族、啟動子和增強子、基因簇及非編碼基因等都可能含有重要的與表型變異密切相關(guān)的多態(tài)性。因為傳統(tǒng)的簡化基因組技術(shù),由于其以隨機的方式研究遺傳變異,獲取的信息大部分在這些區(qū)域之外,就導(dǎo)致了有價值標(biāo)記的檢測缺失。雖然經(jīng)典的微陣列的方法可以規(guī)避這一缺漏,但卻存在著當(dāng)基因池改變時會出現(xiàn)較強的檢測偏差和較差的可重復(fù)性問題。

目前,大規(guī)?;蚍中偷睦щy:

  1. 基因芯片:可以測大量SNP,但很難新增SNP

  2. 熒光定量PCR:價格便宜,但可測的SNP數(shù)量有限

  3. 全基因組測序:可以測大量SNP,但費用高

  4. RAD-Seq/GBS: 無法靶向目標(biāo)區(qū)域

  5. 目標(biāo)區(qū)域捕獲:實驗耗時長,必須測通插入片段

  6. 擴增子測序:優(yōu)化困難,規(guī)模小,不靈活

SPET靶向基因分型,提供了一種快速、可擴展、高效經(jīng)濟的單引物富集技術(shù)(SPET),基于新一代測序技術(shù)對各類生物樣本的特異性靶向區(qū)域SNP進行有針對性的測序分型。該方法可以通過捕獲每個靶向測序序列的SNP特異性數(shù)據(jù)點,提供豐富有效的測序數(shù)據(jù),不僅有效獲得靶向區(qū)分型結(jié)果,更可以快速構(gòu)建具有可擴展性及低成本單SNP位點檢測流程。

技術(shù)流程如下:

1. 將基因組酶切打斷,該步驟操作便捷,可實現(xiàn)自動化;

2. 將片段化的基因組接上indexed adaptor ,DimerFree技術(shù)可消除接頭二聚體的形成;

3. 針對靶向區(qū)域設(shè)計的探針捕獲目標(biāo)區(qū)域捕獲;

4. 擴增后獲得靶向區(qū)域序列文庫,測序后得到分型結(jié)果。


SPET靶向基因分型通過探針設(shè)計及雞尾酒"式的酶切組合進行基因組片段化,能夠有效地將SNP控制在測序讀長范圍內(nèi),輔以優(yōu)化過的探針設(shè)計,確保SNP可通過單端測序測序模式檢出。退火位點的設(shè)計也規(guī)避了已知多態(tài)性位點的位置,以確保擴增過程不會因此而造成偏倚。如果選擇雙端測序測序,還可在read 2中獲得新的未知多態(tài)性位點信息,充實研究結(jié)果。

SPET靶向基因分型的優(yōu)勢如下:

  • 方便在自動化工作站上建庫

  • 設(shè)計靈活

  • 可擴展復(fù)用

  • 集成了酶促打斷

  • 低起始量(10 – 1100 ng

  • 高檢測通量(100 – >100,000 SNPs

  • 建庫周期短(<24 h

截至目前,已有包括人,動物,植物在內(nèi)的多個物種開展了基于SPET技術(shù)的基因分型, SNP在一管內(nèi)的位點達到了30萬。該技術(shù)特別適合中高通量的基因分型,同時具備優(yōu)化SNP的靈活特性。






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